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tdt是什么意思,测序新技术提供基因表达高精数据

03-07 互联网 未知 投稿

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1、测序新技术提供基因表达高精数据

最近,日本东京理科大学的一个研究小组开发了一种新改进的单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术。这种新方法,即终止子辅助固相互补DNA(cDNA)扩增和测序(TAS-Seq),使用简单的材料和设备,提供了比当前广泛使用的技术更精确的单细胞RNA测序数据。研究人员表示,新技术结合了遗传检测灵敏度、反应效率的稳健性和细胞组成的准确性等特性,使研究人员能够捕获重要的细胞信息。这项研究发表在27日的《通讯生物学》杂志上。

单细胞RNA测序的出现为医学和生物学领域带来了革命性的变化,它提供了一次研究数千个细胞内部工作的能力。但单细胞RNA测序方法在确定细胞成分方面,存在潜在的不准确性和低效的cDNA扩增。

新的TAS-Seq技术使用一种称为末端转移酶(TdT)的不依赖于模板的酶来进行cDNA扩增。但TdT很难处理。为了克服这一挑战,研究小组利用双脱氧核苷酸磷酸(ddNTP)作为cDNA扩增反应的“终结者”,极大地降低了TdT反应的技术难度。

TAS-Seq还使用了基于纳米孔的单细胞RNA测序平台,该平台允许分离组织样本中的单个细胞,从而减少细胞采样偏差并提高细胞组成数据的准确性。

研究小组随后验证了TAS-Seq的效率,并将其与目前广泛使用的单细胞RNA测序技术、10X Chromium V2和Smart-seq2进行了比较,其中使用了小鼠和人类肺组织样本。他们发现,与主要的scRNA-seq平台相比,TAS-Seq不仅可检测到更多的整体基因,还可识别更多高度可变的基因。

领导该研究的七野诚之助理教授说:“我们发现TAS-Seq在基因检测灵敏度和基因丢失率方面可能优于10X Chromium V2和Smart-Seq2,这表明TAS-Seq可能是最灵敏的高通量scRNA方法之一。我们可更均匀地检测各种表达水平的基因,也可更有力地检测生长因子和白细胞介素基因。”

新方法的另一个优点是TAS-Seq不太容易受到批次效应的影响。TAS-Seq数据也与组织样本上的流式细胞仪数据高度相关,表明它可以生成高度准确的细胞组成数据。

谈到未来,七野诚之助理教授透露:“我们已经完成了TAS-Seq2的开发,这是对TAS-Seq的一个改进的、经过广泛优化的版本。在小鼠脾细胞中,Tas-seq2的基因检测灵敏度要高1.5到2倍。”

单细胞RNA测序是医学和生物学研究的重要工具。TAS-Seq和TAS-Seq2的开发将引领新的疾病治疗靶点的发现,并在同样依赖于固相cDNA合成的“空间转录学”领域取得进展。它还将加快单细胞组学技术的发展,从而促进人们对生物学和疾病发生发展原理的了解。

(实习记者张佳欣)

来源: 科技日报

2、绿源TDT是什么意思

型号。

TDT是绿源电动车的型号代表,每款电车都有它自己的专属型号,就和人的名字一样,好区分。

绿源电动车是浙江绿源电动车有限公司旗下电动车品牌,创立于1997年,是电动车行业标准参与制定者,致力于为用户提供安心可靠麻烦少的电动车产品,获世界品牌奖,中国最具价值品牌100强,国家五星品牌认证,五星级服务认证,中国轻工业200强企业。

3、TDT是什么意思

TDT

词典结果:

TDT

abbr.transport data 传送(层)数据 time date table 时间日期表 test dwell time 试验停机时间 time delayed triggering 延时触发

以上结果来自金山词霸

例句:

1.

Fitch considers this to be optimistic, given the recent trend of TDT volatility.

4、TDT经理是什么意思

TDT是技术开发团队Technology Development Team的缩写,也就是管理技术开发团队的人员

根据技术管理团队或者公司产品管理团队的任务书,负责技术、平台等的设计、开发与测试。

1. TDT职责

1) 对项目的成功负责,开发、验证并移交给用户PDT,实现业务目标;

2) 项目组成员在所有项目决策中代表自己的功能部门;

3) 管理并执行平台、技术等开发的不同业务与技术要素;

4) 在重要会议上定期汇报进展情况;

5) 执行PDCP合同,项目结束移交所有阶段的活动与交付件;

6) 根据需要,主动从功能部门管理层和技术管理团队处寻求帮助;

7) 做好审计准备。

2. TDT团队组成

1) TDT经理:由技术管理团队或产品管理团队指定和任命;

2) 主要成员:开发、制造、采购、财务、质量等各个功能领域代表;

3) 次要成员:营销、技术支持等各个功能领域代表。

3. TDT运作规则

1) 会议频度:每周;

2) 支撑流程:TPD (技术和平台开发)

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