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1、cerna(microarray)

　　

2、如何预测lncrna与mirna之间的关系

　　长链非编码RNA（10ngnon-coding RNA，lncRNA）是一类转录本长度大于200bp的非编码RNA，可作为人类基因组中一类重要的调控分子通过多种方式发挥其生物学功能．　　近年来的研究表明，lncRNA也可以作为一种竞争性内源性RNA（competing endogenous RNA，ceRNA）与miRNA相互作用，参与靶基因的表达调控，并在肿瘤的发生发展中发挥重要的作用．本综述在简要介绍lncRNA功能研究现状和主要研究方法的基础上，进一步分析了lncRNA与miRNA之间的互相调控关系及其在肿瘤发生发展中的作用，以便为后续的研究提供新的思路．　　

3、如何预测lncRNA的靶基因

　　个人觉得lncrna更有研究前景，mirna序列段作用单一（通过序列互补靶向靶基因降解或者抑制靶基因）各种mirna数据库以及针对mirna靶基因预测以及数据库甚至高通量实验都已经非常完善。但是lncrna是刚处于研究的起始阶段，其功能机制都不太明确，现有研究只能说明lncrna具有多种功能，因此如果你做lncrna可做的东西非常多，加上lncrna功能复杂因此更具有研究前景。　　

4、microrna和lncrna做pcr时可以用同一个试剂盒吗

　　microrna和lncrna做pcr时可以用同一个试剂盒　　长链非编码RNA（10ngnon-coding RNA，lncRNA）是一类转录本长度大于200bp的非编码RNA，可作为人类基因组中一类重要的调控分子通过多种方式发挥其生物学功能．　　近年来的研究表明，lncRNA也可以作为一种竞争性内源性RNA（competing endogenous RNA，ceRNA）与miRNA相互作用，参与靶基因的表达调控，并在肿瘤的发生发展中发挥重要的作用．本综述在简要介绍lncRNA功能研究现状和主要研究方法的基础上，进一步分析了lncRNA与miRNA之间的互相调控关系及其在肿瘤发生发展中的作用，以便为后续的研究提供新的思路．　　

5、WWE里面谁最给力

　　

摔迷 你好

　　

WWE其实我个人觉得每位WWE明星都是非常给力的！他（她）们利用自己的身体、健康为我们表演 难道不给力吗？如果你问我喜欢哪些：其实WWE超级明星（我指一线明星）我基本都喜欢，我最喜欢的前3位是Jeff Hardy/John Cena/Edge！

　　

希望能帮你解决问题！

　　

6、神秘博士第4季 old唱的歌叫什么名字？

　　第十任博士挽歌　　歌曲聆听：　　下载地址：　　... 0&id=3263813033　　原版拉丁文：　　Vale Decem　　Honore res quara　　Emerio　　Alter altera　　Vale Decem　　Emerio　　Alter...　　Alter...ie　　Vale Decem　　Vale Stragem　　Valde Temptua　　De glorio　　Vale de Temptua　　Valde Decet　　Honora res quara　　Alter cerna　　Armis　　Grata tunc, usquera, emani　　Vale..le.. Vale..le..　　Vale..le.. Vale..le..　　(I don"t wanna to go...)　　英文版：　　Farewell, Ten, 永别了，第十任　　Because of your honour 因著你无比的光荣，　　It"s well deserved 这是你绝对应得的　　This other one 另一个人，　　Farewell, Ten, 永别了，第十任　　It"s well deserved 这是你所绝对应得的　　This other one 另一个人，　　This other one of you 另一个的你，　　Farewell, Ten, 永别了，第十任　　Farewell, Carnage, 永别了，所有的大屠杀　　Intense Trials 经过激烈的考验，　　Concerning pride 一个又一个涉及虚荣的考验　　Farewell to these trials 永别了，这些考验　　In a very proper way 在一个适当的方式之下　　Because of your honour 因在你的光荣之下，　　This seperation 这场生离死别，　　Is by force of arms 武力造成的分离　　Flow out all the way with joy 就让一切都被欢乐所冲刷吧　　Farewell... 永别了！　　这首歌是第十任博士重生时的音乐　　一首悲哀、催人泪下的合唱音乐　　是第十任博士的挽歌，亦带领著一个时代终结　　尽管第十任博士想上路，但一个永不回头的时间领主也要继续前行了……　　更新 Song of Freedom：　　Dum inter homines sumus colamus humanitatem. Cum tacent clamant.　　As long as we are among humans, let us be humane. With silence we shout."　　若我们和人类在一起，就让我们变得仁慈。在寂静之下，我们就自然闭嘴了。

7、ceRNA：从机制到功能

ceRNA：从机制到功能

导语

RNA之间可以通过竞争结合共同的microRNA反应元件(microRNA response element, MRE)实现相互调节，这种调控模式构成竞争性内源RNA(Competing endogenous RNA, ceRNA)。已发现的ceRNA包括蛋白编码mRNA和非编码RNA，其中后者包括假基因转录物、长链非编码RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)、环状RNA(Circular RNA, circRNA)等

ceRNA假说

DNA元件百科全书(Encyclopedia of DNA Ele-ments, ENCODE)等研究成果表明人类基因中仅有1%~2%的序列能够编码蛋白质，大量非编码RNA在基因组范围内的作用机制及其对编码基因的调控仍知之甚少。研究发现，RNA之间能通过竞争有限的微RNA池(microRNA pool, miRNA pool)相互影响各自的表达水平。基于这些研究背景，哈佛医学院Pandolfi课题组于2011年提出了竞争性内源RNA(Competing endogenous RNA, ceRNA)假说：他们认为除了已知的microRNA (miRNA)通过与靶基因结合，在转录后水平影响RNA的稳定性和翻译过程，RNA也能反过来影响miRNA的水平。各种类型的RNA转录物以miRNA反应元件(miRNA response elements, MREs)为语言，通过竞争结合共同的miRNA，影响游离miRNA的表达水平，实现相互调节，同时两个RNA之间共有miRNA种类越多，竞争性内源关系越强。

《A ceRNA Hypothesis: The Rosetta Stone of a Hidden RNA Language?》Cell, 2011, 146(3): 353–358

ceRNA分类

ceRNA假说的提出，赋予了mRNA和非编码RNA新的、更广泛的生物学功能。各种类型RNA之间通过RNA-RNA对话(Crosstalk)所构成的调控网络在生物学和病理生理过程中发挥作用。目前ceRNA大致包括mRNA、假基因(Pseudogene)转录物、长链非编码RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)和环状RNA(Circular RNA, circRNA)等。

《Endogenous microRNA sponges: evidence and controversy.》Nat Rev Genet 2016

mRNA作为ceRNA

mRNA作为编码基因的转录物，多数包含有与miRNA种子序列互补结合的区域，也具有与其他mRNA竞争结合相同miRNA的能力，从而参与基因的表达调控。目前研究最多的是第10染色体同源丢失性磷酸酶-张力蛋白(Phosphatase and tensin ho-molog deleted on chromosome 10, PTEN)编码基因的ceRNA

《Coding-independent regulation of the tumor suppressor PTEN by competing endogenousm RNAs》. Cell 147,344–357

circRNA作为ceRNA

circRNA是一类由特殊的选择性剪切产生的非编码RNA，与线性RNA不同的是：circRNA呈封闭环状结构，不受RNA外切酶的影响，表达更稳定。研究表明，某些特殊的circRNA分子富含miRNA结合位点，在细胞中起到miRNA海绵的作用，进而解除miRNA对其靶基因的抑制作用，升高靶基因的表达水平，是一类高效率的ceRNA。如小脑变性相关蛋白1反义链(Cerebellar degeneration-related protein 1 antisense, CDR1as)包含63个保守的miR-7结合位点，该circRNA在细胞中和miRNA效应物密集地结合，能有效地解除miR-7对其靶基因的抑制作用，升高靶基因的表达水平。

《Natural RNA circles function as efficient microRNA sponges》. Nature, 2013, 495(7441): 384–388

表达的3’UTR作为ceRNA

对叉头状转录因子O1(Forkhead transcription factor O1, FoxO1)基因转录的mRNA 3′UTR的研究发现，FoxO1的mRNA在乳腺癌细胞中作为ceRNA调节miR-9的表达，抑制EMT进程和转移过程。这是由于FoxO1 mRNA的3′UTR与E-钙粘蛋白(E-cadherin)基因转录的mRNA 3′UTR通过竞争结合miR-9实现相互调节，表达FoxO1 3′UTR能促进E-cadherin的表达，从而抑制EMT进程。以上研究表明，ceRNA通过调节EMT，从而在肿瘤转移过程中发挥重要作用。

《FOXO1 3'UTR functions as a ceRNA in repressing the metastases of breast cancer cells via regulating miRNA activity》. FEBS Lett, 2014, 588(17): 3218–3224.

假基因转录物作为ceRNA

假基因是一类具有与其功能基因序列相似，通常情况下不具有蛋白质翻译功能的基因，翻译过程因提前终止密码子、移码突变、插入或缺失而中断。假基因在基因组中一直被认为是垃圾基因，但随着研究的深入，发现假基因能通过多个机制促进或抑制其同源基因的表达，增强或抑制其生物功能，其中包括假基因的转录物能作为ceRNA吸附miRNA。假基因的转录物可以作为理想的ceRNA，是由于它们具有很多与其同源基因相同的MRE。

《A coding-independent function of gene and pseudogene mRNAs regulates tumour biology》. Nature, 2010, 465(7301): 1033–1038.

lncRNA作为ceRNA

lncRNA是一类长度大于200nt、由RNA聚合酶Ⅱ或Ⅲ转录、保守性较低的非编码RNA，并且其转录物可通过多种调节机制参与生物学过程。目前已发现超过10 000种lncRNA可能具有潜在的ceRNA特性，许多研究已经证实lncRNA作为miRNA和mRNA的竞争平台，在病理和生理相关过程中发挥重要作用。

《CREB up-regulates long non-coding RNA, HULC expression through interaction with micro-RNA-372 in liver cancer》.Nucleic Acids Res, 2010, 38(16): 5366–5383.

作为ceRNA的非编码RNA及其生物学功能

ceRNA调控网络除了影响信号通路，还能以其他方式参与肿瘤的发生和发展过程。

ceRNA数据库

1.http://www.oncomir.umn.edu/cefinder/

Sarver等建立了首个ceRNA数据库（competing endogeous RNA database,ceRDBｃ可用于预测互为ceRNA的mRNA。

2.http://starbase.sysu.edu.cn/

一个高通量实验数据CLIP-Seq（或称为HITS-CLIP,PAR-CLIP,iCLIP）和mRNA降解组测序数据支持的microRNA靶标数据库,包含了miRNA-mRNA，miRNA-lncRNA，miRNA-circRNA，miRNA-ceRNA 和RNA-protein等的调控关系。整合和构建了最全面的靶标预测软件的交集和调控关系。

3 miRecord http://mirecords.biolead.org/

一个整合的microRNA靶标数据库，整合了多个靶标预测软件的调控关系。

4.http://www.bioinfo.tsinghua.edu.cn/~liuke/Linc2GO/index.html

清华大学建立了长链基因间非编码RNA数据库Linc2GO，他们基于ceRNA假说来注释这些lncRNA的功能。

ceRNA研究策略

《Endogenous microRNA sponges: evidence and controversy.》Nat Rev Genet 2016

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